La principal aplicación de Clorito de Sodio (NaClO2) es la generación de dióxido de cloro para el blanqueamiento de la pulpa de papel. También se utiliza para la desinfección de algunas máquinas de tratamiento de agua después de la conversión de dióxido de cloro. Una de las ventajas de esta aplicación, en comparación con el cloro utilizado, es que los trihalometanos (como el cloroformo) no son producidos por los contaminantes orgánicos. El Clorito de sodio, también tiene uso como componente de enjuagues terapéuticos, bucales, pastas y gels, aerosoles para boca, goma de mascar y caramelos, también en la solución de limpieza de lentes de contacto.

También se utiliza para la desinfección de conductos de aire y en las zonas de confinamiento de animales (paredes, pisos y otras superficies); en detergentes para el hogar, incluyendo el jabón de lavandería líquido, el de lavar platos y productos de limpieza doméstica; las aplicaciones industriales de riego agente (mojado), la agricultura de herbicidas emulsionante y polimerización.

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